В Академии продолжают работать два диссертационных совета:
Совет К 310.001.02 по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата экономических наук по специальности 08.00.05 -«Экономика и управление народным хозяйством (экономика, организация и управление предприятиями, отраслями, комплексами -сфера услуг (таможенная деятельность)».Председатель диссертационного совета СВ. Барамзин, д-р экон. наук, профессор.
Совет К 310.001.01 по специальности «Уголовный процесс, криминалистика и судебная экспертиза; оперативно-розыскная деятельность». Председатель диссертационного совета В.А. Жбанков, д-р юрид. наук, профессор.